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Sistema Informático de Secuencias Genéticas de HIV (SISGEN – HIV)

El Sistema Informático de Secuencias Genéticas (SISGEN – HIV) es una herramienta bioinformática desarrollada para el Laboratorio de Biología Celular y Retrovirus del Hospital Garrahan.
El objetivo principal es poder vincular la información de datos clínicos con datos de secuencias, de tratamientos y de SNPs de niños infectados con HIV. El sistema permite cargar y hacer uso de esa información mediante las búsquedas por distintos criterios y la visualización amigable de los resultados.
En el laboratorio de retrovirus se realizan diversos estudios (estudios genotípicos de resistencia a los antirretrovirales, estudio de datos de laboratorio, análisis de polimorfismos), los cuales se encontraban almacenados en variados formatos y sistemas (como ser planillas Excel, bases Access e incluso en el sistema interno del Hospital). Con la nueva herramienta se logró centralizar y organizar toda la información, permitiendo vincular los datos de los distintos módulos fácilmente y automatizar la comunicación con bases de datos externas (HIV Sequence Locator de Los Alamos y HIV Drug Resistance Database de Stanford University) y con el sistema propio del Hospital. Más información.

Sistema Informático de Secuencias Genéticas de HIV (SISGEN – HIV)

ProteinQ

ProteinQ es un servicio web que permite vincular información biológica con divervas bases de datos. Este servicio brinda una base de datos que funciona como una página donde los investigadores pueden buscar información de sitios de interes, y como una herramienta para la priorización de sitios en genomas completos.

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ProteinQ