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BIA webservices

sobre BIA

La Plataforma Bioinformática Argentina (BIA) está destinada a brindar servicios bioinformáticos tanto al Sistema Científico Nacional como a Organismos y Empresas públicas y privadas de diversos sectores económicos con proyección regional e internacional.

BIA está dirigida y gestionada por un equipo multidisciplinario consolidado de profesionales con una larga trayectoria científica y profesional en el campo de la bioinformática.

“Brindamos soluciones bioinformáticas eficientes incorporando tecnologías de Investigación y Desarrollo (I+D) de última generación.”

Director

Dr. Adrián Turjanski

Gerente Tecnológico

Dr. Marcelo Martí

Gerente Comercial

Lic. Germán Biagioli

Desarrolladores

Lic. Germán Burguener
Lic. Gerónimo Dubra
Dr. Darío Fernández Do Porto
Ing. Leonardo Lucianna
Ing. Ezequiel Sosa
Lic. Jonathan Zaiat

nodos de investigación

bases de datos biológicas

IIB-INTECH, UNSAM
Desarrollo de bases de datos biológicas y de aplicaciones web para visualización y consulta.

El nodo de Bases de Datos Biológicas de la UNSAM tiene un sólido historial de desarrollo de bases de datos biológicas y químicas, que apoyan y complementan la investigación y desarrollo. El grupo ha desarrollado la base de datos TDR Targets para desarrollo de drogas en enfermedades tropicales y desatendidas, y la base de datos TcSNP, que constituye el primer mapa genético a escala genómica para Trypanosoma cruzi, el agente causal de la Enfermedad de Chagas. El nodo ofrece servicios de consultoría y desarrollo en todas las áreas relacionadas con el diseño e implementación de bases de datos relacionales, procesos de carga de datos, y aplicaciones web dedicadas (lógica del negocio) en apoyo de la investigación y el desarrollo en ciencias de la vida. El nodo trabaja en conjunto con otros nodos de BIA para brindar servicios integrados de principio a fin, en casos que requieran un conjunto más diverso de expertise y/o de accesso a la infraestructura computacional instalada.

Servicios

  • Diseño de bases de datos relacionales
  • Implementación en MySQL, PostgreSQL de schemas customizados o de schemas de uso frecuente en bioinformática (GUS, GMOD/Chado)
  • Diseño e implementación de pipelines para carga de datos en bases de datos relacionales
  • Diseño e implementación de aplicaciones web para visualización y consulta de datos en bases de datos relacionales
Dr. Fernán Agüero Director

Dr. Fernán Agüero

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genómica de alto rendimiento

INDEAR - CONICET
Secuenciación ADN de alto rendimiento y análisis de grandes volúmenes de datos.

Análisis de secuenciación de gran escala.

Servicios

  • Deep Metagenomic analysis
  • Environmental 16s Metagenomic profiling (Qiiime and related)
  • Microbiome analysis
  • RNA-seq analysis
  • Whole human Genome sequencing
  • Whole human Exome sequencing
  • Illumina TruSight panels analysis and reporting
  • Chip-seq analysis
Dr. Martín Vázquez Director

Dr. Martín Vázquez

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bio data mining

Universidad Católica de Cordoba - CONICET
Métodos estadísticos / computacionales para análisis de datos masivos en biología.

El BDMG tiene una importante trayectoria en el análisis de bases de datos biológicas. Aborda problemas de diseño experimental y análisis de datos mediante técnicas estadístico/computacionales.

Servicios

  • Diseño experimental en experimentos genómicos y proteómicos
  • Análisis de control de calidad de microarrays (microarrays Agilent, Illumina y Affymetrix), RNAseq (Illumina, SOLID, IOn Torrent) y de datos de secuenciadores (Illumina, SOLID, IOn Torrent)
  • Análisis de control de calidad de 2D-DIGE
  • Análisis de expresión diferencial de genes (microarrays Agilent, Illumina y Affymetrix), RNAseq (Illumina, SOLID, IOn Torrent), proteínas (2D-DIGE)
  • Análisis funcional tipo Set Enrichment Analysis (SEA) y Functional Clustering (MEA) via Gene Ontology
  • Hosting de datos y resultados y plataforma de seguimiento del trabajo con acceso restringido
  • Análisis de control de calidad de datos de Amplicon Sequencing via ION Torrent
  • Análisis de cobertura
  • Análisis de variantes
  • Análisis Chip-seq
  • Detección y análisis de Splicing Alternativo
  • Gene Set Enrichment Analysis.
Dr. Elmer Fernández Director

Dr. Elmer Fernández

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bioinformática estructural

FCEyN, UBA
Análisis de estructura y función de biomoléculas y diseño racional de drogas y proteínas.

El nodo de Bioinformática Estructural de la FCEyN, UBA ha acumulado a lo largo de los últimos años una gran experiencia en el desarrollo y utilización de herramientas de simulación computacional en el área de estructura y función de biomoléculas. Específicamente, se cuenta con metodologías de simulación clásicas, para la predicción de propiedades estructurales, dinámicas e interacciones entre biomoléculas y entre biomoléculas y fármacos, como así también estrategias basadas en la mecánica cuántica para realizar estudios de actividad enzimática. El nodo es altamente complementario con los otros nodos de la Plataforma Bioinformática Argentina.

Servicios

  • Búsqueda virtual de fármacos
  • Diseño de biomoléculas para usos biotecnológicos
  • Quimioinformática
  • Modelos faramacocinéticos
  • Análisis estructural y dinámico de proteínas
Dr. Darío Estrin Director

Dr. Darío Estrin

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HPC IT

FCEyN, UBA
Computación de alto rendimiento.

La Computación de Alto Rendimiento (HPC por sus siglas en inglés) es un campo altamente dinámico, el cual se nutre tanto de los últimos avances en tecnología de cómputo como en el rediseño y optimización de aplicaciones para buscar que su ejecución sea eficiente en sistemas de gran escala. Hoy en día, las aplicaciones deben poder adaptarse para funcionar en un diverso abanico de posibilidades tecnológicas: múltiples cores en memoria compartida, clusters de miles de procesadores, elementos de cómputo específicos (GPGPU), Grid y Cloud Computing.

Servicios

  • Asistencia tecnológica en temas de HPC.
  • Implementación de nuevas tecnologías de cómputo en aplicaciones existentes.
  • Coordinación de desarrollo de aplicaciones paralelas y distribuidas.
Dr. Esteban Mocskos Director

Dr. Esteban Mocskos

Sitio web